ALMERÍA
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Albufera Honda | Litoral/costero | Albufera de Adra | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Albufera Nueva | Litoral/costero | Albufera de Adra | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Salinas de Cerrillos | Artificial o modificado | Punta Entinas-Sabinar | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de la Gravera | Artificial o modificado | Punta Entinas-Sabinar | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Charcones de Punta Entinas | Litoral/costero | Punta Entinas-Sabinar | Paraje Natural Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Salinas de Cabo de Gata | Artificial o modificado | Cabo de Gata-Níjar | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA.ZEPIM. Reserva de la Biosfera |
| Rambla Morales | Litoral/costero | Cabo de Gata-Níjar | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA.ZEPIM. Reserva de la Biosfera |
| Balsa del Sabinar | Interior | __ | __ | __ |
| Cañada de las Norias | Artificiales | __ | __ | __ |
CÁDIZ
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Laguna Salada de Zorrilla | Interior | Complejo Endorreico de Espera | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna Hondilla | Interior | Complejo Endorreico de Espera | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna Dulce de Zorrilla | Interior | Complejo Endorreico de Espera | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna del Taraje | Interior | Complejo Endorreico Puerto Real | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de San Antonio | Interior | Complejo Endorreico Puerto Real | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna del Comisario | Interior | Complejo Endorreico Puerto Real | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna Chica | Interior | Complejo Endorreico Puerto Sta. María | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna Salada | Interior | Complejo Endorreico Puerto Sta. María | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna Juncosa | Interior | Complejo Endorreico Puerto Sta. María | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de las Canteras | Interior | Laguna de las Canteras y El Tejón | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna del Tejón | Interior | Laguna de las Canteras y El Tejón | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Medina | Interior | Laguna de Medina | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Montellano | Interior | Complejo Endorreico de Chiclana | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Jeli | Interior | Complejo Endorreico de Chiclana | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de la Paja | Interior | Laguna de la Paja | Reserva Natural Concertada | __ |
| Laguna del Picacho | Interior | Alcornocales | Parque Natural | ZEPA |
| Lagunetas de Alcalá | Interior | Alcornocales | Parque Natural | ZEPA |
| Charca de la Camilla | Interior | Sierra de Grazalema | Parque Natural | ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna del Perezoso | Interior | Sierra de Grazalema | Parque Natural | ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Desembocadura del Río Guadiaro | Litoral/costero | Estuario del río Guadiaro | Paraje Natural | ZEPA |
| Marismas del Río Palmones | Litoral/costero | Marismas del río Palmones | Paraje Natural | ZEPA |
| Bahía de Cádiz | Litoral/costero | Bahía de Cádiz. | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Marismas de Barbate | Litoral/costero | De la Breña y Marismas del Barbate | Parque Natural | ZEPA |
| Laguna Playa de los Lances | Litoral/costero | Playa de los Lances | Paraje Natural | ZEPA |
| Cola del Embalse de Arcos | Artificial o modificado | Cola del Embalse de Arcos | Paraje Natural | ZEPA |
| Cola del Embalse de Bornos | Artificial o modificado | Cola del Embalse de Bornos | Paraje Natural | ZEPA |
| Marismas de Bonanza | Litoral/artificial | Doñana | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna del Tarelo | Artificial o modificado | Doñana | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Codo de la Esparraguera | Artificial o modificado | __ | __ | __ |
| Complejo Palustre Interdunar Cabo de Trafalgar | Litoral/costero | __ | __ | __ |
| Laguna de Los Tollos | Interior | __ | __ | __ |
| Complejo Intermareal de Castilnovo | Litoral/costero | __ | __ | __ |
| Marisma de Casablanca | Continental | __ | __ | __ |
| Salinas de Santa María | Artificial o modificado | __ | __ | __ |
CÓRDOBA
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| La Nava Alta de Cabra | Interior | Sierras Subbéticas | Parque Natural | ZEPA |
| El Navazuelo | Interior | Sierras Subbéticas | Parque Natural | ZEPA |
| Laguna del Conde o Salobral | Interior | Laguna del Conde o Salobral | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Zóñar | Interior | Laguna de Zóñar | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna del Rincón | Interior | Laguna del Rincón | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Santiago | Interior | Laguna del Rincón | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Tíscar | Interior | Laguna de Tíscar | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna Dulce | Interior | Laguna Amarga | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna Amarga | Interior | Laguna Amarga | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Los Jarales | Interior | Laguna de los Jarales | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Molina Ramírez | Interior | Laguna de los Jarales | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de Remendado | Interior | Laguna de los Jarales | Reserva Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Sotos de la Albolafia | Interior | Sotos de la Albolafia | Monumento Natural | __ |
| Embalse de la Cordobilla | Artificiales | Embalse de Cordobilla | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Embalse de Malpasillo | Artificiales | Embalse de Malpasillo | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna del Donadío | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna del Taraje | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de la Quinta | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna del Rincón del Muerto | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Cortijo Viejo | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Curado | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Vadohondo o Laguna Salada | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Jarambel o Laguna de Chica | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Butaquillo | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de la Roa | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Casasola | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Navarredonda o Laguna de Los Arenales | Continental | __ | __ | __ |
GRANADA
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Lagunas de Alta Montaña de Sierra Nevada | Interior | Sierra Nevada | Parque Natural | ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Turberas de Padul | Interior | Sierra Nevada | Parque Natural | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna del Rico | Interior | — | — | — |
| Laguna Grande de Granada | Interior | — | — | — |
| Laguna del Concejo | Interior | — | — | — |
| Nacimiento del Parrilla | Interior | — | — | — |
| Charca de Suárez | Litoral / Costero | — | Reserva Natural Concertada | — |
| Laguna Larga | Interior | — | — | — |
| Saladar de El Margen | Interior | — | — | — |
| Charco del Negro | Interior | — | — | LIC “Sierra de Loja” |
| Pantaneta de Alhama | Continental / Artificial | — | — | PEPMF: Paisaje protegido |
| Laguna Seca | Continental | Sierra de Castril | Parque Natural | LIC Sierra de Castril. ZEPA Sierra de Castril |
| Laguna de las Trincheras | Continental | — | — | — |
| Cola del Embalse del Negratín | Continental / Artificial | — | — | — |
| Charco del Alcántar | Continental / Seminatural | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Charco del Cantón | Continental / Artificial | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Charco del Jabalí | Continental / Seminatural | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Charco de Las Fuentes I | Continental / Seminatural | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Charco de Las Fuentes II | Continental / Artificial | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Charco del Pozuelo | Continental / Seminatural | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Charco del Ranchuelo | Continental / Seminatural | — | — | LIC “Sierra de Loja” PEMPF Complejo Serrano de Interés Ambiental Sierra Gorda |
| Laguna del Puerto | Continental / Seminartificial | — | — | — |
HUELVA
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Marismas de Isla Cristina | Litoral/costero | Marismas de Isla Cristina | Paraje Natural | ZEPA |
| Laguna del Pinillo | Artifical o modificado | Marismas de Isla Cristina | Paraje Natural | ZEPA |
| Marismas del Río Piedras y Flecha del Rompido | Litoral/costero | Marismas del río Piedras y Flecha del Rompido | Paraje Natural | ZEPA |
| Lagunas de los Cabezos del Terrón | Interior | Marismas del río Piedras y Flecha del Rompido | Paraje Natural | ZEPA |
| Turberas de Lancón | Interior | Marismas del río Piedras y Flecha del Rompido | Paraje Natural | ZEPA |
| Laguna de El Portil | Litoral/costero | Laguna de El Portil | Reserva Natural | __ |
| Laguna de la Dehesilla | Interior | Laguna de El Portil | Reserva Natural | __ |
| Laguna del Cuervo | Interior | Laguna de El Portil | Reserva Natural | __ |
| Laguna de las Pajas | Interior | Laguna de El Portil | Zona de Protección Reserva Natural | __ |
| Laguna de Gamonales | Interior | Laguna de El Portil | Zona de Protección Reserva Natural | __ |
| Laguna del Chaparral | Interior | Laguna de El Portil | Zona de Protección Reserva Natural | __ |
| Laguna del Medio o de los Barracones | Litoral/costero | Laguna de El Portil | Zona de Protección Reserva Natural | __ |
| Marismas del Odiel | Litoral/costero | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna del Puntal Hondo | Interior | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna del Batán | Interior | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna del Taraje | Interior | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Gravera de Puntales | Artifical o modificado | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Pantaneta Güijarro | Artifical o modificado | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Gravera del Halcón | Artifical o modificado | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna de la Herradura | Interior | Marismas del Odiel | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna Primera de Palos | Interior | Lagunas de Palos y las Madres | Paraje Natural | RAMSAR |
| Laguna de la Jara | Litoral/costero | Lagunas de Palos y las Madres | Paraje Natural | RAMSAR |
| Laguna de la Mujer | Interior | Lagunas de Palos y las Madres | Paraje Natural | RAMSAR |
| Laguna de las Madres | Interior | Lagunas de Palos y las Madres | Paraje Natural | RAMSAR |
| Estero de Domingo Rubio | Litoral/costero | Estero de Domingo Rubio | Paraje Natural | ZEPA |
| Lagunas del Abalario | Interior | Doñana | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Turberas de Ribatehilos | Interior | Doñana | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| La Rocina | Interior | Doñana | Parque Nacional | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Lagunas Peridunares de Doñana | Interior | Doñana | Parque Nacional | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Corrales del sistema de dunas móviles de Doñana | Interior | Doñana | Parque Nacional | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Navazos y llanos de las Marismillas | Interior | Doñana | Parque Nacional | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Plana de inundación del Partido | Interior | Doñana | Parque Nacional /Parque Natural | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Lagunas de Coto del Rey | Interior | Doñana | Parque Nacional /Parque Natural | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Marisma de Doñana | Litoral/costero | Doñana | Parque Nacional /Parque Natural | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Laguna Dehesa del Estero | Interior | __ | __ | __ |
| Complejo Palustre Interdunar Dunas del Odiel | Artificial | __ | __ | __ |
| Laguna del Águila | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Doña Elvira | Interior | __ | __ | __ |
| Gravera de la Balastrera | Artificiales | __ | __ | __ |
| Gravera de Manzorrales | Artificiales | __ | __ | __ |
| Complejo Endorréico Lagunas de Matalagrana | Interior | __ | __ | __ |
JAEN
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Laguna Grande | Interior | Laguna Grande | Paraje Natural | __ |
| Laguna del Chinche | Interior | Laguna del Chinche | Reserva Natural | RAMSAR |
| Laguna Honda | Interior | Laguna Honda | Reserva Natural | RAMSAR |
| Laguna de Siles | Interior | Sierras de Cazorla, Segura y las Villlas | Parque Natural | ZEPA.Reserva de la Biosfera |
| Laguna de Orcera | Interior | Sierras de Cazorla, Segura y las Villlas | Parque Natural | ZEPA.Reserva de la Biosfera |
| Laguna de Valdeazores | Interior | Sierras de Cazorla, Segura y las Villlas | Parque Natural | ZEPA.Reserva de la Biosfera |
| Embalse de Pedro Marín | Artificial o modificado | Alto Guadalquivir | Paraje Natural | ZEPA |
| Embalse de Doña Aldonza | Artificial o modificado | Alto Guadalquivir | Paraje Natural | ZEPA |
| Embalse del Puente de la Cerrada | Artificial o modificado | Alto Guadalquivir | Paraje Natural | ZEPA |
| Laguna de Argamasilla | Interior | __ | __ | __ |
| Lagunas de Brujuelo y Cirueña | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Garcíez | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Hituelo | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Perales | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Prados del Moral | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Las Navas | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Casillas | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Naranjeros y Rumpinsaco | Interior | __ | __ | __ |
MÁLAGA
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Laguna Dulce | Interior | Lagunas de Campillos | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna Salada | Interior | Lagunas de Campillos | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna del Cerero | Interior | Lagunas de Campillos | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna de Camuñas | Interior | Lagunas de Campillos | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna de Capacete | Interior | Lagunas de Campillos | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna Redonda | Interior | Lagunas de Campillos | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna de la Ratosa | Interior | Lagunas de la Ratosa | Reserva Natural | ZEPA |
| Herriza de los Ladrones | Interior | Lagunas de la Ratosa | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Lobón | Interior | Laguna de Fuente de Piedra | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna Grande | Interior | Lagunas de Archidona | Reserva Natural | __ |
| Laguna Chica | Interior | Lagunas de Archidona | Reserva Natural | __ |
| Laguna de Fuente de Piedra | Interior | Laguna de Fuente de Piedra | Reserva Natural | RAMSAR. ZEPA |
| Laguna de Cantarranas | Interior | Laguna de Fuente de Piedra | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguneto del Pueblo | Interior | Laguna de Fuente de Piedra | Reserva Natural | ZEPA |
| Desembocadura del Río Guadalhorce | Litoral/costero | Desembocadura del Guadalhorce | Paraje Natural | __ |
| Laguna de la Caja | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Los Prados | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna del Chaparral | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Viso | Interior | __ | __ | __ |
| Desembocadura del Río Vélez | Litoral/costero | __ | __ | __ |
| Laguna de La Marcela | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Toro | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Cortijo Grande | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Herrera | Continental | __ | __ | __ |
SEVILLA
| Humedal/es | Tipología de Humedal | Espacio Natural Protegido en el que se encuentra | Figura legal de protección | Otras figuras de protección |
| Laguna de la Ballestera | Interior | Complejo Endorreico de la Lantejuela | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Calderón Chica | Interior | Complejo Endorreico de la Lantejuela | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Calderón Grande | Interior | Complejo Endorreico de la Lantejuela | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de la Alcaparrosa | Interior | Complejo Endorreico de Utrera | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Zarracatín | Interior | Complejo Endorreico de Utrera | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de Arjona | Interior | Complejo Endorreico de Utrera | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna del Gosque | Interior | Laguna del Gosque | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna del Charroao | Interior | Complejo Endorreico Lebrija-Las Cabezas | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna del Taraje | Interior | Complejo Endorreico Lebrija-Las Cabezas | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna del Pilón | Interior | Complejo Endorreico Lebrija-Las Cabezas | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de la Cigarrera | Interior | Complejo Endorreico Lebrija-Las Cabezas | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de la Galiana | Interior | Complejo Endorreico Lebrija-Las Cabezas | Reserva Natural | ZEPA |
| Laguna de la Peña | Interior | Complejo Endorreico Lebrija-Las Cabezas | Reserva Natural | ZEPA |
| Corredor Verde del Guadiamar | Interior | Corredor Verde del Guadiamar | Paisaje Protegido | __ |
| Brazo del Este | Litoral/costero | Brazo del Este | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Laguna de la Dehesa de Abajo | Artificial o modificado | Dehesa de Abajo | Reserva Natural Concertada | __ |
| Cañada de los Pájaros | Artificial o modificado | Cañada de los Pájaros | Reserva Natural Concertada | __ |
| Laguna del Arroyo Sajón | Interior | Doñana | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Veta la Palma | Litoral/costero | Doñana | Parque Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Embalse de Cordobilla | Artificial o modificado | Embalse de Cordobilla | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Embalse de Malpasillo | Artificial o modificado | Embalse de Malpasillo | Paraje Natural | RAMSAR.ZEPA |
| Lagunas de Coto del Rey | Interior | Doñana | Parque Nacional /Parque Natural | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Marisma de Doñana | Litoral/costero | Doñana | Parque Nacional /Parque Natural | RAMSAR. ZEPA. Reserva de la Biosfera |
| Pantaneta de Capellanías | Artificial o modificado | __ | __ | __ |
| Laguna de Gobierno | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de Coripe | Interior | __ | __ | __ |
| Humedal el Pantano | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de La Ventosilla | Interior | __ | __ | __ |
| Laguna de La Malagueña | Interior | __ | __ | __ |
| Humedal de Cerro de las Cigüeñas | Continental / Artificial o modificado | __ | __ | __ |
| Laguna del Grillo | Continental | __ | __ | __ |
| Laguna de Ruíz Sánchez | Continental | __ | __ | ZEPA |
| Laguna del Terrosillo | Continental | __ | __ | ZEPA |
| Laguna de San Lázaro | Continental | __ | __ | ZEPA |